Le projet scientifique universitaire était incompatible avec les options politiques.
La rupture des relations entre l’Université de Johannesburg (JU) et l’Université Ben Gourion en Israël (BGU), qui sera effective à partir du 1er avril, est considérée comme « une gifle à la liberté académique et scientifique », par le South African Jewish Board of Deputies (SAJBD) (organisation équivalente du Crif en France). Son président, Zev Krengel a déclaré que « plutôt que de profiter d’un projet de coopération scientifique concernant la purification de l’eau qui aurait des bénéfices potentiels énormes pour l’Afrique du Sud, l’UJ a choisi de suivre le programme d’un groupe d’agitateurs anti-Israël. ». Bien que les recherches sur l’eau propre soient, effectivement, cruciales pour l’avenir de l’Afrique du Sud – pollution massive par les drainages acides des mines, les engrais et l’industrie – le Comité Petition UJ a déclaré officiellement que le conseil universitaire avait trouvé des « preuves significatives » que la BGU était impliquée dans des recherches et autres contrats avec l’armée israélienne, en particulier concernant son occupation de Gaza.